פרופ' ירון אורנשטיין

ביואינפורמטיקה וביולוגיה חישובית

ריצוף גנטי בימינו מפיק כמויות עצומות של מידע על דנ״א, רנ״א, וחלבונים. בתוך הנתונים האלה מסתתרים דפוסים קריטיים לאפיון פעילות בתאים והבנת תהליכי מחלות, כמו בקרת ביטוי גנים וקיפול ופעילות חלבונים. האתגר הוא לפתח שיטות חישוביות שיזהו את הדפוסים האלה, יפיקו מהם תובנות ביולוגיות, ויובילו לתגליות מדעיות חדשות.

מחקרו של פרופ׳ ירון אורנשטיין מתמקד בפיתוח שיטות חישוביות לניתוח נתונים ביולוגיים עתירי תפוקה. קבוצת המחקר עוסקת בניתוח נתונים גנומיים, אימון רשתות נוירונים, שילוב מקורות מידע הטרוגניים והעברת ידע בין מערכי ניסוי שונים. לצד זאת, הקבוצה מפתחת שיטות לפרשנות מודלים, כדי להבין לא רק מה המודל חוזה - אלא גם אילו תובנות ביולוגיות ניתן להפיק ממנו.

תחום נוסף במחקרו עוסק בפיתוח אלגוריתמים לתכנון רצפי דנ״א, רנ״א, וחלבונים, במטרה לייעל ניסויים ולנתח נתוני עתק. חלק מהבעיות ניתנות לפתרון יעיל בזמן פולינומי, לעיתים באמצעות רדוקציה לבעיות על גרפים. אחרות מוגדרות כקשות חישובית (NP-hard), ולכן נדרשות עבורן שיטות קירוב ויוריסטיקות, כמו תכנות לינארי בשלמים.

תחומי מחקר מרכזיים:

• ביואינפורמטיקה וביולוגיה חישובית

• ניתוח נתונים גנומיים

• למידה עמוקה ורשתות נוירונים

• פרשנות מודלים ותכנון רצפי דנ״א, רנ״א, וחלבונים

 אופי המחקר:

תיאורטי-יישומי: פיתוח שיטות חישוביות ואלגוריתמים לצד יישום וניסוי בתוכנה

אופק תעסוקתי:

בוגרות ובוגרי הקבוצה רוכשים יכולות במדעי הנתונים, ביולוגיה חישובית, ואלגוריתמיקה, ומשתלבים במחקר בביוטק, פארמה, פיתוח תרופות, וביולוגיה סינתטית.

אתר קבוצת המחקר: yaronorenstein0.wixsite.com/orensteinlab